外包服务
转录组作为基因组的功能元件,包括了多种不同类别的分子,如mRNA,miRNA,lncRNA,cirRNA,rRNA,tRNA,piRNA等。每一类分子在生理响应过程中都发挥了重要的作用。理解这些分子的调控对于更好理解功能基因组极为关键。通过转录组高通量测序技术,比较不同组织、细胞之间的转录组层面的表达量变化或结构变异(如cSNP、可变剪接、融合基因等),可以揭示生物学现象或疾病发生的分子机制。
技术参数
样本 |
总量&浓度 |
文库类型 |
目标RNA富集方式 |
推荐数据量 |
测序策略 |
项目周期 |
|
---|---|---|---|---|---|---|---|
数字基因表达谱(DGE) |
Total |
基因组DNA |
普通转录组文库 |
Olig dT磁珠调取mRNA |
≥3G clean data |
HiSeq PE150 |
35个工作日 |
真核转录组 |
m≥30 μg,c≥100 ng/μL |
普通转录组文库 |
Olig dT磁珠调取mRNA |
≥8G clean data |
HiSeq PE150 |
35个工作日 |
|
原核转录组 |
PacBio为主,与HiSeq等其他平台结合 |
普通转录组文库/链特异性文库 |
Ribozero试剂盒去除rRNA |
≥2G clean data (有参) ≥3G clean data(无参) |
HiSeq PE150 |
35个工作日 |
|
miRNA |
m≥3 μg c≥200 ng/μL |
Small RNA文库 |
≥10M reads |
HiSeq SE50 |
35个工作日 |
||
lncRNA |
m≥4 μg c≥120 ng/μL |
链特异性文库 |
Ribozero试剂盒去除rRNA |
≥12G clean data |
HiSeq PE150 |
45个工作日 |
生物信息分析内容
广州生物医药公共服务平台新药创制与转化医学服务中心依托广州生物工程中心与高校共建的模式动物转化医学联合实验室,搭建了拥有一流大型仪器设备的由药物设计与制备、生命组学与精准医学、药物与药械评价、新型药物制剂、模式动物、转化医学研究七大专业性子平台构建形成的新药创制与转化医学综合服务平台。平台聚焦为企业、高校、研究所、医院的科研转化需求提供强有力的服务支撑,目前已形成了由国家特聘专家领衔,近20名博士后为技术骨干,数十名博士、硕士为服务中坚的高素质服务团队,团队具备丰富的开发实施经验,已完成了多种药物的探索与开发的服务委托,并在心脑血管疾病、呼吸系统疾病、免疫性疾病、炎症性疾病、代谢性疾病、神经性疾病等领域有坚实的研究基础,构建了基础医学与临床需求转化的服务桥梁。同时,平台也将为广州乃至华南地区的投融资机构、企业提供科技成果转化验证服务,平台作为生物医药领域内的第三方服务机构,可以为待转化的科研成果提供客观、公正的验证服务,降低投资和转化过程中存在的技术风险。
咨询电话: 020-87568623-614
咨询QQ: 99196406
邮箱: hzg@gzbio.org