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动植物基因组测序
全基因组重测序是指对已有参考基因组的物种进行基因组测序,可在个体和群体水平上进行差异性分析。通过序列比对,可全面挖掘基因序列的差异位点及结构变异。已成为动植物分子育种、群体进化中最迅速和有效的方法之一。
测序策略:HiSeq X ten PE150,推荐测序深度:10~30X
项目周期:35个工作日
1、数据质控
技术参数
样本类型:基因组DNA,样本总量≥3 μg,样本浓度:≥30 ng/μL
测序策略:HiSeq X ten PE150,推荐测序深度:10~30X
项目周期:35个工作日
生物信息分析内容
1、数据质控
2、与参考基因组比对
3、SNP/ InDel/ SV/ CNV检测、注释及统计
4、转座子检测、注释及统计
广州生物医药公共服务平台新药创制与转化医学服务中心依托广州生物工程中心与高校共建的模式动物转化医学联合实验室,搭建了拥有一流大型仪器设备的由药物设计与制备、生命组学与精准医学、药物与药械评价、新型药物制剂、模式动物、转化医学研究七大专业性子平台构建形成的新药创制与转化医学综合服务平台。平台聚焦为企业、高校、研究所、医院的科研转化需求提供强有力的服务支撑,目前已形成了由国家特聘专家领衔,近20名博士后为技术骨干,数十名博士、硕士为服务中坚的高素质服务团队,团队具备丰富的开发实施经验,已完成了多种药物的探索与开发的服务委托,并在心脑血管疾病、呼吸系统疾病、免疫性疾病、炎症性疾病、代谢性疾病、神经性疾病等领域有坚实的研究基础,构建了基础医学与临床需求转化的服务桥梁。同时,平台也将为广州乃至华南地区的投融资机构、企业提供科技成果转化验证服务,平台作为生物医药领域内的第三方服务机构,可以为待转化的科研成果提供客观、公正的验证服务,降低投资和转化过程中存在的技术风险。
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