中国科学院广州生物医药与健康研究院公用仪器中心于2006年11月29日正式成立并投入使用。集中了研究院所有的大型设备和公用性强的普通设备，其中价值大于20万元人民币的设备总价值已达5300万元人民币，其他设备共计1000万元人民币。公用仪器中心秉着“做好支撑，服务科研”的理念，广泛服务于院内外多个国家和地方的科研项目，积极为院内外的科学研究提供了良好的技术支撑服务。公用仪器中心于2009年成为中科院第一批所级技术服务中心，持续6年获得中科院所级技术支撑中心的运行经费支持。2012年，牵头成立了广州生命科学大型仪器区域中心，成员单位包括中国科学院华南植物园、中国科学院广州能源研究所、中国科学院南海海洋研究所、广东省微生物研究所、广东省生态环境与土壤研究所、广东省昆虫研究所。目标是打造具有区域特色且符合研究需求的集大型科研装备、一流技术人才、重大科研任务于一体的支撑华南地区乃至全国在生物资源发掘与利用、人口与健康、生态与环境等领域的生命科学公共技术平台。

仪器中心可承接化合物定性、定量分析；蛋白质结构分析、分离；病毒分离、核酸转染；细胞结构与表型分析；细胞凋亡及周期分析；细胞分选；同位素相关实验等业务。