外包服务
表观遗传测序ChIP-seq
染色质免疫共沉淀技术（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具，通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。将ChIP与新一代测序技术相结合的ChIP-seq技术，能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。
ChIP-Seq首先通过染色质免疫共沉淀技术（ChIP）特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段，并对其进行纯化与文库构建，然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。研究人员通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上，从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段信息。
实验流程
技术参数
样本类型：已ChIP富集的DNA样品，样本总量≥50 ng，样本浓度≥10 ng/μL
测序策略：HiSeq SE50，推荐测序数据量：≥10M clean reads（转录因子），≥20 M clean reads（组蛋白）
项目周期：35个工作日
生物信息分析内容
1、数据质控
2、与参考序列比对
3、单样本分析
3.1 Motif分析
3.2 Peaks注释与概况
3.3 Peaks相关基因功能富集分析
4、多样本分析
4.1 Motif分析
4.2 Peaks注释与概况
4.3 Peaks相关基因功能富集分析
4.4 差异Peak分析
4.5 差异Peaks相关基因注释与功能富集分析
4.6 SCC分析
广州生物医药公共服务平台新药创制与转化医学服务中心依托广州生物工程中心与高校共建的模式动物转化医学联合实验室，搭建了拥有一流大型仪器设备的由药物设计与制备、生命组学与精准医学、药物与药械评价、新型药物制剂、模式动物、转化医学研究七大专业性子平台构建形成的新药创制与转化医学综合服务平台。平台聚焦为企业、高校、研究所、医院的科研转化需求提供强有力的服务支撑，目前已形成了由国家特聘专家领衔，近20名博士后为技术骨干，数十名博士、硕士为服务中坚的高素质服务团队，团队具备丰富的开发实施经验，已完成了多种药物的探索与开发的服务委托，并在心脑血管疾病、呼吸系统疾病、免疫性疾病、炎症性疾病、代谢性疾病、神经性疾病等领域有坚实的研究基础，构建了基础医学与临床需求转化的服务桥梁。同时，平台也将为广州乃至华南地区的投融资机构、企业提供科技成果转化验证服务，平台作为生物医药领域内的第三方服务机构，可以为待转化的科研成果提供客观、公正的验证服务，降低投资和转化过程中存在的技术风险。
咨询电话： 020-87568623-614
咨询QQ: 99196406
邮箱： hzg@gzbio.org
