2b-RAD是2012年wang等推出基于II B型限制性内切酶的大规模SNP标记开发和分型的技术（Nature Methods（Wang et al, 2012））。该技术克服了RAD-Seq、GBS等技术的缺点，通过基因组酶切产生等长的33-36bp的酶切标签，标签富集后测序分析，实现全基因组范围高通量SNP筛查和分型分析。
 
 

技术特点

 
1、具有极强的灵活性，标签数目多少可控
2、标签长度一致，PCR时具有一致的扩增效率
3、标签具有位置特异性，不依赖于参考序列和组装结果
4、除可利用共显性标记SNP之外，还可以利用显性标记
5、基于混合泊松分布模型的de novo SNP分型新算法（iML），可有效去除重复序列对分型的干扰，
分型准确率明显优于目前已有算法，假阳性降低高达20%
 

技术流程

 

生物信息分析内容


基础信息分析 
1、数据预处理 
2、高质量标签获取 
3、标签聚类  
4、基于iML算法的SNP分型 
5、标记分离分析 
6、遗传图谱构建 
定制信息分析内容 
1、QTL定位（需客户提供表型数据） 
2、遗传图谱整合（需客户提供原图谱数据） 
3、全基因组关联分析 




应用方向

 

1、高密度遗传图谱及QTL精细定位 
2、群体遗传学研究 
3、群体进化分析 
4、全基因组关联分析 


技术参数

 

样本类型：基因组DNA，样本总量≥1 μg， 样本浓度≥200 ng/μL 

 

基因组标签平均密度：2kb 

 

标签平均深度：≥20X 

 

分型准确率：≥95% 

 

测序策略：HiSeq PE150 

 

项目周期：60个工作日 




备注：
物种：待测样品为二倍体生物，对于多倍体物种暂不适用
样品背景：明确的作图群体间的亲缘关系，检测子代个体数≥100

     广州生物医药公共服务平台新药创制与转化医学服务中心依托广州生物工程中心与高校共建的模式动物转化医学联合实验室，搭建了拥有一流大型仪器设备的由药物设计与制备、生命组学与精准医学、药物与药械评价、新型药物制剂、模式动物、转化医学研究七大专业性子平台构建形成的新药创制与转化医学综合服务平台。平台聚焦为企业、高校、研究所、医院的科研转化需求提供强有力的服务支撑，目前已形成了由国家特聘专家领衔，近20名博士后为技术骨干，数十名博士、硕士为服务中坚的高素质服务团队，团队具备丰富的开发实施经验，已完成了多种药物的探索与开发的服务委托，并在心脑血管疾病、呼吸系统疾病、免疫性疾病、炎症性疾病、代谢性疾病、神经性疾病等领域有坚实的研究基础，构建了基础医学与临床需求转化的服务桥梁。同时，平台也将为广州乃至华南地区的投融资机构、企业提供科技成果转化验证服务，平台作为生物医药领域内的第三方服务机构，可以为待转化的科研成果提供客观、公正的验证服务，降低投资和转化过程中存在的技术风险。
 

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