研究、追踪与控制人禽流感H5N1毒株来源是预防人禽流感的主要措施;国内人禽流感研究多立足于现场流行病学调查和实验室检测,国外于2006年有一篇关于1997年香港人禽流感H5N1毒株来源研究,但仅分析流感受体结合位点,且未分析2005-2006年毒株,包括我国毒株。本课题采用生物信息学方法,从GenBank和LANL等网站下载全球人类和动物人禽流感H5N1毒株基因序列,采用分子生物学软件DNAStart 5.0和Treeview等,分析广东、国内、国外该毒株8个节段基因的核苷酸、氨基酸、糖蛋白、二级结构和同源性,揭示人禽流感毒株8个节段基因特征和可能来源,为预防和控制人禽流感大流行提供依据。
本项目的创新点包括,①采用生物信息学方法,全面分析国内、外人禽流感H5N1毒株八个节段基因,为全面掌握H5N1毒株各基因变异规律提供信息;②全面分析人禽流感H5N1毒株与动物相应毒株关系,分析人类H5N1毒株八个节段与动物相应毒株节段基因关系,进行毒株节段重组和来源分析,为控制人禽流感传染源提供依据。
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