广州生物医药公共服务平台 | 广州生物医药网
PubMed关键字搜索

请输入搜索关键字,例如:cancer "stem cell"

基因检索


第二步: 选择基因识别码类型

第三步:: 其他选项
 
对原发性黑色素瘤上调表达基因的分析

  GenCLiP 2.0主要功能是基因的功能注释和分子网络构建,为广大生物医学研究人员提供一站式的服务,并且可以充分依靠他们的专业知识进行信息的深度挖掘。从单个基因检索到批量基因分析;从基因的人工注释到文献关键词自动注释;从自动的文献关键词注释到手动添加自由词注释;词相关基因搜索从基于摘要到基于句子的共发生;从基因网络的自动构建到人工构建自由词的基因网络;从批量基因的模糊聚类到平均连锁等级聚类。

对899个原发性黑色素瘤上调表达基因进行分析

    1、基因功能注释(关键词)模糊聚类结果

image

    对注释结果产生聚类分析热图

image

    2、系统自动构建分子网络

image

    编辑搜索词,构建与搜索词相关的子网络
与凋亡(输入"Apoptosis,Apoptotic")相关的分子网络(图),网络中显示与黑色素瘤(输入" melanoma,melanomas",网络中橙色显示)相关的基因。

image

    与转移(输入" metastasis,metastases")相关的分子网络(图),网络中显示与黑色素瘤(输入" melanoma,melanomas",网络中橙色显示)相关的基因。

image

    说明:以EGFR为例,EGFR与TGFA同时出现的文献数为9篇;EGFR与EREG同时出现的文献数为3篇;EGFR与KRT7同时出现的文献数为1篇;EGFR与AR同时出现的文献数为1篇;EGFR与SERPINB3同时出现的文献数为2篇;EGFR与TP63同时出现的文献数为1篇;EGFR与KRT5同时出现的文献数为5篇;EGFR与DCN同时出现的文献数为1篇;EGFR与BTC同时出现的文献数为1篇;

    2、GO和通路功能注释

    系统自动对GO注释模糊聚类的结果

image

    对GO注释结果产生聚类分析热图

image

    系统自动对通路注释模糊聚类的结果

image

    对通路注释结果产生聚类分析热图

image