广州生物医药公共服务平台生物医药网络文献挖掘系统

GenCLiP 2.0

帮助您快速的查询特定疾病/功能与相对应的多个基因的文献资料，实现基因的功能注释和分子网络构建。无论是单个基因检索或批量基因分析，还是对基因的人工注释和文献关键词自动注释，从自动的文献关键词注释到手动添加，GenCLiP 2.0都能成为您的科研好助手...

  GenCLiP 2.0主要功能是基因的功能注释和分子网络构建，为广大生物医学研究人员提供一站式的服务，并且可以充分依靠他们的专业知识进行信息的深度挖掘。从单个基因检索到批量基因分析；从基因的人工注释到文献关键词自动注释；从自动的文献关键词注释到手动添加自由词注释；词相关基因搜索从基于摘要到基于句子的共发生；从基因网络的自动构建到人工构建自由词的基因网络；从批量基因的模糊聚类到平均连锁等级聚类。

    对324个鼻咽癌上调表达基因进行分析：

    1、基因功能注释（关键词）模糊聚类结果

    产生聚类分析热图

    2、根据鼻咽癌的特点，在系统自动的功能注释结果的基础上进行编辑，添加和删除注释，添加"Nasopharyngeal Carcinoma"，列表中以红色显示

    对编辑后的结果产生聚类分析热图

    一般可调整压缩

    3、系统自动构建分子网络

    编辑搜索词，构建与搜索词相关的子网络 与凋亡（输入"Apoptosis,Apoptotic")相关的分子网络（图），网络中显示与鼻咽癌（输入"Nasopharyngeal Carcinoma",网络中橙色显示)相关的基因。

    与细胞迁徙（输入"Migration")相关的分子网络（图），网络中显示与鼻咽癌（输入"Nasopharyngeal Carcinoma",网络中橙色显示)相关的基因。

    4、GO和通路功能注释

    系统自动对GO注释模糊聚类的结果

    对GO注释结果产生聚类分析热图

    挑选部分GO注释产生聚类分析热图

    系统自动对通路注释模糊聚类的结果

    对通路注释结果产生聚类分析热图