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- 原理简介
微滴式数字PCR(Droplet Digital PCR,ddPCR)系统在传统的PCR扩增前对样本进行微滴化处理,将含有核酸分子的反应体系分成数万个含有或不含待检测核酸靶分子的纳升级微滴。经PCR扩增后,对每个微滴的荧光信号进行逐一分析,有荧光信号的微滴判读为1,没有荧光信号的微滴判读为0,根据泊松分布原理及阳性微滴的个数与比例即可得出靶分子的起始拷贝数或浓度。
- 操作流程
- 仪器设备
- 技术特征
►能够检测含量极低的核酸序列
微滴化步骤可实现对靶标DNA/RNA的富集,灵敏度可达单个核酸分子,检测限低至0.001%,可实现痕量核酸的高灵敏度检测,适用于DNA定量分析、肿瘤突变分析和基因分型等。 无需标准品,即可对靶标分子起始量进行绝对定量
►能够有效区分浓度差异微小的样品
更好的准确度、精密度和重复性,可用于精确测定靶基因的相对表达、基因拷贝数变异分析等。
►对PCR抑制剂的容忍度更高,适合基质复杂样品的检测
终点PCR检测,不依赖Ct值,不依赖扩增效率,能克服PCR抑制剂的影响;适合动物血样、FFPE组织、粪便、尿液、唾液、水样、土壤、植物等复杂样品中DNA的绝对定量。对PCR抑制剂的容忍度更高,适合基质复杂样品的检测
- 应用分类
服务案例之 遗传性胸腺瘤的基因检测
1、临床发现
临床医生发现同一家庭出现两个胸腺瘤患者,且符合以下特征,考虑为首次发现的遗传性胸腺瘤家系:
一个家族同时出现两个患胸腺瘤的病人;
Ⅲ2患者在27岁患病;
罕见肿瘤;
无外环境风险因素。
2、基因检测与验证
采集患两个患者的血样进行外显子测序,分析验证结果显示二者均存在SETD2基因突变:
3、SETD2在肿瘤中的突变
服务案例之 溶瘤病毒VG001在小鼠CRC中的抗肿瘤作用
1、研究背景:在现有免疫疗法中,免疫检查点抑制剂PD-1单抗在MSI型结直肠癌(colorectal cancer,CRC)的临床治疗中效果显著,但占总数约85%的MSS型CRC仍然缺乏有效的治疗方法。近期兴起的溶瘤病毒疗法作为一类对肿瘤细胞杀伤效率高、靶向性好和适用性广的新型免疫疗法,或许可为MSS型CRC的临床试验提供新的方向。
2、溶瘤病毒VG001在MSS型CRC中的复制与杀伤
3、VG001在小鼠MSS型CRC肿瘤模型中的抗肿瘤效果
4、VG001在CT-26肿瘤模型中的免疫机制
1) 使用BD FACSCelesta™流式细胞分析仪检测VG001瘤内注射后的免疫浸润情况:
2)分析结果:
广州生物医药公共服务平台新药创制与转化医学服务中心依托广州生物工程中心与高校共建的模式动物转化医学联合实验室,搭建了拥有一流大型仪器设备的由药物设计与制备、生命组学与精准医学、药物与药械评价、新型药物制剂、模式动物、转化医学研究七大专业性子平台构建形成的新药创制与转化医学综合服务平台。平台聚焦为企业、高校、研究所、医院的科研转化需求提供强有力的服务支撑,目前已形成了由国家特聘专家领衔,近20名博士后为技术骨干,数十名博士、硕士为服务中坚的高素质服务团队,团队具备丰富的开发实施经验,已完成了多种药物的探索与开发的服务委托,并在心脑血管疾病、呼吸系统疾病、免疫性疾病、炎症性疾病、代谢性疾病、神经性疾病等领域有坚实的研究基础,构建了基础医学与临床需求转化的服务桥梁。同时,平台也将为广州乃至华南地区的投融资机构、企业提供科技成果转化验证服务,平台作为生物医药领域内的第三方服务机构,可以为待转化的科研成果提供客观、公正的验证服务,降低投资和转化过程中存在的技术风险。
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